Affymetrix CytoScan^TM HD芯片

实验流程

产品特点

· 目前密度最高的细胞遗传学芯片。含有跨越270万种探针，同时具备CNV探针和SNP探针，平均覆盖全基因组，对于＞40kb的基因组结构变异检出率达99%。SNP探针进行SNP分型的准确率高于99%。

· 实现低水平嵌合发现、LOH和获得性 UPD (aUPD) 检测、拷贝数变化确认、三倍体检测、等位基因失衡模式发现、基因组污染鉴定、trio一致性检查及家系分析。

· 基因覆盖全面。拥有跨越 260 万个拷贝数探针，涵盖了所有 OMIM™ 和 RefSeq 基因。

样本要求：DNA≥1.0μg ；   物种：人

Affymetrix OncoScan™ 芯片

实验流程

产品特点

· 使用分子倒置探针(MIP)技术，针对FFPE样本优化设计（探针结合处只需40bp的碱基）

· 全基因组拷贝数分析，检测基因结构变异，如缺失、重复、LOH、cnLOH、断裂点测定、倍性、嵌合和不平衡易位

· 所需起始DNA量少（仅需 80 ng FFPE来源DNA），陈旧FFPE样本也有效（10年或者更久）

· 结果稳定性高，不同批次之间以及不同操作员之间均可得出标准化结果

· 在特定癌症基因中进行高分辨率拷贝数检测，能准确识别极小(50‒125 kb) 至大 (Mb) 范围内的变异

样本要求：DNA≥80 ng ，FFPE 切片（10片以上，切片厚度10μm左右，面积250mm²左右）；物种：人